Василий Филиппович Рункин родился 27 апреля 1924 года в селе Мокрое Сасовского района Рязанской области. С 1942 года участник Великой Отечественной войны, которую закончил в звании лейтенанта. Командовал ротой, за боевые заслуги награжден орденом Красной Звезды и медалями. Инвалид войны.
После войны закончил Ленинградский сельскохозяйственный институт и аспирантуру. С 1951 по 1954 год работал сначала инструктором сельскохозяйственного отдела Ленинградского обкома ВКП(б), а потом вторым секретарем Ефимовского (ныне Бокситогорского) райкома партии. Одним из первых откликнулся на призыв поехать на село и возглавить колхозное строительство.
В 1954 году был избран председателем колхоза "Новый быт", который из убыточного превратил в один из лучших колхозов Ефимовского района. В 1955 году стал кандидатом экономических наук.
В 1966 году В.Ф. Рункину было поручено возглавить выборгский совхоз "Матросово", к тому времени совершенно развалившийся и с убытком почти в полмиллиона рублей. За период его руководства, продолжавшегося до 1987 года, это хозяйство превратилось в высокорентабельное сельхозпредприятие с мощной производственной базой. Первым в Выборгском районе "Матросово" стало совхозом-миллионером, то есть с годовой прибылью более миллиона рублей.
В совхозе развернулось строительство животноводческих ферм, сенных и зерновых сараев, картофелехранилищ, жилья, объектов социальнокультурного назначения. Разрабатывались и внедрялись в производство передовые технологии. Молочное стадо увеличилось вдвое, а продуктивность - в полтора раза. Годовое производство молока достигло почти девяти тысяч тонн. По этим показателям совхоз "Матросово" не имел себе равных в Выборгском районе и считался одним из лучших в Ленинградской области. Многомиллионные прибыли, получаемые совхозом "Матросово", кроме собственных нужд, направлялись в другие хозяйства района на строительство производственных мощностей, жилья, объектов соцкультбыта.
В 1971 году совхоз Матросово” за высокие производственные результаты был награжден Красным Знаменем Министерства сельского хозяйства СССР и ЦК профсоюза, в 1972 году - Красным Знаменем Совета Министров СССР и ВЦСПС, в 1977 году Красным знаменем ЦК КПСС, Совета Министров СССР. ВЦСПС и ЦК ВЛКСМ. Высоко были отмечены и личные заслуги Василия Филипповича. К ордену Трудового Красного Знамени прибавились ордена Октябрьской революции и Ленина, а также медали, в том числе Золотая и Бронзовая медали ВДНХ. В 1963 году В.Ф .Рункин был избран депутатом Верховного Совета РСФСР, неоднократно избирался депутатом Ленинградского областного Совета депутатов трудящихся. С 1987 года - персональный пенсионер союзного значения.
Похоронен - п. Советский